Protein–RNA interactions for Protein: P0C7X2

ZNF688, Zinc finger protein 688, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF688P0C7X2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF688P0C7X2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms