Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DOAP06340 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DOAP06340 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms