Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FGAP02671 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FGAP02671 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FGAP02671 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FGAP02671 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FGAP02671 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FGAP02671 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FGAP02671 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FGAP02671 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGAP02671 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGAP02671 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGAP02671 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGAP02671 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGAP02671 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGAP02671 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGAP02671 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGAP02671 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGAP02671 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FGAP02671 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FGAP02671 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FGAP02671 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms