Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
IGHG1P01857 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IGHG1P01857 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms