Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMC2O95347 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMC2O95347 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMC2O95347 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMC2O95347 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC2O95347 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC2O95347 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMC2O95347 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMC2O95347 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMC2O95347 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC2O95347 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC2O95347 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC2O95347 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC2O95347 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC2O95347 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC2O95347 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC2O95347 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMC2O95347 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms