Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RHOBTB3O94955 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms