Protein–RNA interactions for Protein: O75808

CAPN15, Calpain-15, humanhuman

Predictions only

Length 1,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN15O75808 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN15O75808 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN15O75808 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms