Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCATO75600 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCATO75600 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCATO75600 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCATO75600 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GCATO75600 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GCATO75600 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GCATO75600 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GCATO75600 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms