Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
E2F6O75461 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
E2F6O75461 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
E2F6O75461 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
E2F6O75461 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms