Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRIN3BO60391 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRIN3BO60391 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms