Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EFNA2O43921 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFNA2O43921 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms