Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
STRNO43815 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRNO43815 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRNO43815 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRNO43815 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRNO43815 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRNO43815 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRNO43815 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRNO43815 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms