Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYNGR3O43761 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms