Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HTRA2O43464 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms