Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERI3O43414 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERI3O43414 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERI3O43414 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERI3O43414 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ERI3O43414 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERI3O43414 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERI3O43414 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERI3O43414 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERI3O43414 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERI3O43414 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERI3O43414 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
ERI3O43414 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERI3O43414 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ERI3O43414 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms