Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MSH5O43196 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSH5O43196 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSH5O43196 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSH5O43196 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MSH5O43196 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSH5O43196 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSH5O43196 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSH5O43196 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSH5O43196 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSH5O43196 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MSH5O43196 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MSH5O43196 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MSH5O43196 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MSH5O43196 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MSH5O43196 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MSH5O43196 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MSH5O43196 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MSH5O43196 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MSH5O43196 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MSH5O43196 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms