Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLDN34H7C241 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms