Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF879B4DU55 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF879B4DU55 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms