Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MEIS3P2A8K0S8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MEIS3P2A8K0S8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms