Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPIPB13A6NJU9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NPIPB13A6NJU9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms