Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POTEFA5A3E0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POTEFA5A3E0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms