Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRD1A4D1F6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms