Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC66A2RUB6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms