Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
C9orf170A2RU37 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C9orf170A2RU37 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms