Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
E2F8A0AVK6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
E2F8A0AVK6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms