Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD54BQ9Y620 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms