Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP16Q9Y5T5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP16Q9Y5T5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms