Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRPRBQ9Y5M8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRPRBQ9Y5M8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRPRBQ9Y5M8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRBQ9Y5M8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRBQ9Y5M8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRPRBQ9Y5M8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms