Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C3orf18Q9UK00 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C3orf18Q9UK00 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms