Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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RABGEF1Q9UJ41 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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RABGEF1Q9UJ41 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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RABGEF1Q9UJ41 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RABGEF1Q9UJ41 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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