Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAX2Q9UIW0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms