Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms