Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DKK2Q9UBU2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms