Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTRRQ9UBK8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MTRRQ9UBK8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms