Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HMG20BQ9P0W2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HMG20BQ9P0W2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms