Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL6

SIDT1, SID1 transmembrane family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIDT1Q9NXL6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SIDT1Q9NXL6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms