Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDLIM7Q9NR12 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDLIM7Q9NR12 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms