Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SEC31BQ9NQW1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEC31BQ9NQW1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms