Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INCENPQ9NQS7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INCENPQ9NQS7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms