Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PNPLA8Q9NP80 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PNPLA8Q9NP80 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms