Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms