Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP29Q9HBJ7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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