Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF408Q9H9D4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF408Q9H9D4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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