Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TDRD3Q9H7E2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TDRD3Q9H7E2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms