Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NLRP1Q9C000 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NLRP1Q9C000 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms