Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD1

MRPL13, 39S ribosomal protein L13, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL13Q9BYD1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MRPL13Q9BYD1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL13Q9BYD1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms