Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM42Q9BTD8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM42Q9BTD8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms