Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AGMATQ9BSE5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AGMATQ9BSE5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms