Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GDF15Q99988 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GDF15Q99988 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms