Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTPN18Q99952 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN18Q99952 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms